간암환자의 혈청 CA19-9와 AFP 수치와의 관계 및 현황
간암환자의 혈청 CA19-9와 AFP 수치와의 관계 및 현황
2020.01. 13
1. 대상논문
제목: 간암 환자에서 혈청 CA-19-9 측정의 임상적 의의 2)저자: 김연수 외 2인 3)게재지: 대한내과학회지: 제 37 권 제 5 호
활용데이터
건수: 2017~2019년, 3년 사이에 간암 진단을 받은 간암환자 레지스트리 데이터 중 AFP 및 CA19-9 수치가 밝혀졌으며, 두 수치가 지나치게 큰 데이터를 제외한 408 건
테이블: 간암 대상자(LVER_PT_TRGT) 등
본 논문은 원발성 간암 진단을 받은 환자를 중심으로, 종양 표지자인 CA19-9와 AFP, CEA 등의 혈중 수치 간의 상관관계와 그 현황을 살펴본 논문이다.
본 시각화에서는 데이터 부재 및 추출 등의 제한적 요소로 인해, 간암 레지스트리 데이터 대상, 원발/전이 여부를 가리지 않은 간암 환자 대상으로 CA19-9 음/양성 현황과 CA19-9, AFP 수치간의 상관관계에 대해 시각화를 ㅈ진행하였다.
간암 환자의 CA 19-9 음/양성 현황
논문에서는 간암 환자의 CA19-9 양성 비율이 20% 내외 정도라고 보고있으며(논문 p.633), 원발성 및 전이성 간암 환자의 CA 19-9 양성률을 살펴보았다. 이에 착안하여, CA19-9 음/양성 현황에 대한 시각화를 진행하였다.
## 시각화 코드
ggplot(lver4, aes(x="", y=..count.., fill= CA19_9_NP)) + geom_bar(stat="count", width = 1.0, color="white") + coord_polar(theta = "y", start = 0) + geom_text(mapping=aes(label=paste0(round(..count../sum(..count..)*100),"%")),stat ="count",vjust=-1.3, hjust=0.5, face="bold", size=5, position = position_stack(vjust = 0.5),color="white", face="bold") + ggtitle("간암 환자의 CA19-9 음/양성 비율", )+ theme(plot.title = element_text(size=15, face="bold", hjust = 0.5)) + labs(x="", y="", fill = "양성 여부")
분석 대상 데이터 중, 양성은 약 21%로, 논문의 수치와 거의 흡사하게 나타났다.
혈청 AFP 수치에 따른 CA19-9의 상관관계
논문에서는 혈청 AFP치에 따른 원발상 간암 예에 대해서, CA19-9 상승 추이 및 상관관계 여부를 살펴보고자 한다(논문 p.634). 이에 착안하여 시각화를 진행하였다.
## 시각화 코드
lver_graph <-
ggplot(lver4, mapping=aes(x=AFP, y=CA19_9, group=1, color = AFP)) + geom_point(stat="identity", size=2, alpha=2, shape=20) + scale_colour_gradient2(low = "#0033FF", mid = "#CC99FF", high = "red", midpoint = mean(lver4$AFP), guide = F)+ labs(x="AFP 수치", y="CA19-9 수치") + ggtitle("간암 환자에서 혈청 AFP치에 따른 CA19-9의 상관관계") + theme_economist()
lver_graph + theme(legend.position = "bottom", plot.title = element_text(family = "serif",size=15, face="bold", hjust = 0.5))
시각화 결과, AFP 수치 200 이하에서 어느정도 상관관계를 반영하는 미약한 양의 상관관계를 보였으나, 전체적인 산점도로 확인했을 때는, 점들이 일정한 경향없이 산발한 모습을 보았다. 이로 미루어보아, AFP수치와 CA19-9 수치 간에는 뚜렷한 상관관계가 없다고 결론 내릴 수 있다.
## 시각화 코드
cor.test(lver4$AFP, lver4$CA19_9)
Pearson's product-moment correlation
data: lver4$AFP and lver4$CA19_9
t = 1.6693, df = 406, p-value = 0.09583
alternative hypothesis: true correlation is not equal to 0
95 percent confidence interval:
-0.01464025 0.17821787
sample estimates:
cor
0.08256173
상관분석 결과, 상관계수는 약 0.08로, 의미있는 분석 결과를 나타내지 못했다.
Last updated
